Étiquette : protéomique

Développement de biomarqueurs pour évaluer la ‘healthspan’ et les défis des ‘clocks’ de vieillissement

La recherche sur le vieillissement a fait des avancées significatives avec le développement de ‘clocks’ de vieillissement basés sur des données omiques. Ces outils visent à évaluer les effets de thérapies potentielles pour ralentir ou inverser les aspects du vieillissement. Toutefois, un défi majeur demeure : il est difficile de prédire si un ‘clock’ donné reflétera fidèlement les résultats futurs après un traitement spécifique. En effet, il n’existe pas de carte détaillée reliant les données omiques qui composent un ‘clock’ aux mécanismes sous-jacents du vieillissement ou aux résultats associés. Cela complique la capacité des chercheurs à anticiper comment un ‘clock’ de vieillissement réagira aux modifications des mécanismes ciblés par un traitement, rendant nécessaire de calibrer ces ‘clocks’ dans le cadre d’études longues et coûteuses, ce qui va à l’encontre de l’objectif initial de ces outils.

La focalisation de la recherche sur le vieillissement a récemment évolué, passant de l’augmentation de la longévité à l’amélioration de la ‘healthspan’, c’est-à-dire la période de vie sans incapacité. Malgré les efforts pour développer des biomarqueurs de vieillissement, peu d’études se sont concentrées sur les biomarqueurs de ‘healthspan’. Pour remédier à cette lacune, une signature protéomique de ‘healthspan’, appelée Healthspan Proteomic Score (HPS), a été développée. Cette signature utilise des données protéomiques issues de l’essai Olink Explore 3072, basé sur un échantillon de 53 018 individus et 2 920 protéines. Une valeur HPS basse a été liée à un risque accru de mortalité et à plusieurs conditions liées à l’âge, telles que la maladie pulmonaire obstructive chronique, le diabète, l’insuffisance cardiaque, le cancer, l’infarctus du myocarde, la démence et l’accident vasculaire cérébral. Le HPS a démontré une précision prédictive supérieure par rapport à d’autres mesures d’âge biologique. Les protéines associées au HPS étaient enrichies dans des voies clés comme la réponse immunitaire, l’inflammation, la signalisation cellulaire et la régulation métabolique. La validité externe a été évaluée à l’aide de l’étude sur l’épigénétique de l’hypertension essentielle, qui a également utilisé des données protéomiques issues de l’Olink Explore 3072, ainsi que des données épigénétiques complémentaires. Cela en fait un outil précieux pour évaluer la ‘healthspan’ et un potentiel marqueur substitut pour compléter les mesures d’âge biologique protéomique et épigénétique existantes dans les études guidées par la géroscience. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/06/the-healthspan-proteomic-score/

Analyse des Protéines Plasmiques et leur Association avec le Vieillissement Biologique

Au cours des vingt dernières années, des recherches sur un ensemble de plus en plus diversifié des horloges biologiques de vieillissement ont démontré que l’analyse d’une base de données biologiques suffisamment complexe permettra de trouver des corrélations avec l’âge. Le vieillissement provoque des changements liés à l’accumulation de formes de dommages cellulaires et tissulaires. Étant donné que ce type de dommage est commun à tous, malgré des variations individuelles dans le rythme du vieillissement, il existe un certain nombre de changements spécifiques liés à l’âge dans les données biologiques qui se produisent de manière similaire chez presque tous les individus. À une époque où l’obtention et l’analyse de données coûtent peu, nous devons nous attendre à un flux continu d’articles où les chercheurs identifient des changements liés à l’âge de plus en plus spécifiques. Dans cette étude, les données de 51 904 participants de la UK Biobank ont été analysées pour explorer l’association entre 2 923 protéines plasmatiques et neuf phénotypes liés au vieillissement. Ces phénotypes comprennent PhenoAge, l’âge biologique KDM, la durée de vie parentale, la fragilité et la longévité. Les niveaux de protéines ont été mesurés à l’aide de la protéomique. La méthode DE-SWAN a été utilisée pour détecter et mesurer les altérations non linéaires dans le protéome plasmatique au cours du vieillissement biologique. Une randomisation mendélienne a été appliquée pour évaluer les relations causales, et une étude d’association à l’échelle du phénotype (PheWAS) a exploré les impacts globaux de ces protéines sur la santé. L’étude a identifié 227 protéines significativement associées au vieillissement, mettant en lumière les voies de l’inflammation et de la régénération. Les résultats ont révélé des motifs fluctuants dans le protéome plasmatique au cours du vieillissement biologique chez les adultes d’âge moyen, soulignant des pics spécifiques de changements liés à l’âge biologique à 41, 60 et 67 ans, ainsi que des modèles de changement protéique liés à l’âge distincts à travers divers organes. De plus, la randomisation mendélienne a soutenu l’association causale entre les niveaux plasmatiques de plusieurs protéines et le vieillissement, soulignant leur importance en tant que cibles médicamenteuses. L’analyse PheWAS des protéines associées au vieillissement a mis en évidence leurs rôles cruciaux dans des processus biologiques vitaux, en particulier en ce qui concerne la mortalité globale, le maintien de la santé et la santé cardiovasculaire. En outre, les protéines peuvent servir de médiateurs dans les modes de vie sains et les processus de vieillissement. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/05/an-example-of-proteomic-correlations-with-aging/

Exploration des biomarqueurs de longévité : Perspectives de la métabolomique et de la protéomique

Le texte aborde la recherche sur les biomarqueurs associés à la longévité humaine, en mettant l’accent sur les échantillons de sang et les méthodes non invasives. Il souligne l’importance de développer des outils efficaces pour mesurer le vieillissement biologique afin d’accélérer les thérapies de lutte contre le vieillissement. Les études sur les centenaires et les bases de données ‘omics’ fournissent des informations précieuses. Les biomarqueurs liés à la longévité, découverts grâce à la métabolomique et à la protéomique, sont classés selon différentes catégories. Les mécanismes d’action de certains métabolites, notamment des acides gras, sont expliqués, bien que beaucoup de leurs effets restent inconnus. Les protéines clés comme l’APOE, FOXO et SIRT jouent un rôle essentiel dans la survie cellulaire en régulant divers processus métaboliques et inflammatoires. Le texte souligne également l’importance des modifications post-traductionnelles des protéines dans la longévité. Les méthodes analytiques appropriées sont cruciales, et il est noté que la métabolomique ciblée pourrait mieux refléter l’état physiologique des personnes âgées. Les échantillons sanguins et fécaux sont couramment utilisés pour la découverte de biomarqueurs, bien que l’accès aux échantillons de tissus soit plus complexe. L’article conclut en exprimant l’espoir que de meilleures technologies permettront d’explorer les spécificités tissulaires des centenaires dans le futur. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/a-discussion-of-circulating-metabolite-and-protein-markers-of-human-longevity/

Le UK Biobank lance l’étude de protéomique la plus vaste au monde

Le UK Biobank a lancé une étude ambitieuse et sans précédent visant à analyser 5 400 protéines à partir de 600 000 échantillons, promettant de nouvelles avancées significatives dans la compréhension de la santé et de la longévité. Cette initiative vise à approfondir la compréhension des interactions complexes entre la génétique, le mode de vie et les maladies, ouvrant ainsi la voie à d’importantes avancées en santé publique et en recherche médicale. En tant que pilier essentiel de la recherche sur la longévité et l’espérance de vie en bonne santé, le UK Biobank offre un ensemble de données unique qui a déjà permis d’importantes découvertes pour améliorer la santé publique. Avec un large registre de 500 000 participants, le UK Biobank permet des analyses statistiques robustes et, grâce à son approche longitudinale, il capture les évolutions cruciales de la santé au fil du temps, permettant ainsi d’explorer la progression du vieillissement et l’apparition de maladies liées à l’âge.

L’étude de protéomique récemment annoncée renforce encore les contributions du UK Biobank dans ce domaine. Ce projet, par son ampleur et sa profondeur, offre une opportunité sans précédent de suivre les changements protéiques durant la vie moyenne à tardive et leur rôle dans le développement des maladies. En intégrant des données protéomiques, génétiques et d’imagerie, les chercheurs souhaitent identifier des biomarqueurs protéiques, développer des modèles prédictifs pour les maladies liées à l’âge et faire avancer la médecine personnalisée. Les résultats de cette étude devraient également faciliter la découverte de médicaments et les interventions thérapeutiques, offrant ainsi une nouvelle perspective sur les conditions liées à l’âge.

Le projet de protéomique impliquera 500 000 participants du UK Biobank, avec la collecte de 100 000 échantillons supplémentaires jusqu’à 15 ans plus tard pour capturer les changements longitudinaux dans l’expression des protéines. Cela fournira des informations critiques sur l’évolution des niveaux de protéines au fil du temps, en particulier durant les phases de vie moyenne à tardive, et comment ces variations s’alignent avec le développement de maladies chroniques. Les échantillons seront analysés à l’aide de technologies avancées comme la plateforme Olink, permettant une mesure précise et à haut débit des biomarqueurs protéiques.

Cette étude offre des perspectives prometteuses pour mieux comprendre comment les protéines influencent les voies de la maladie et le vieillissement, avec des implications spécifiques pour l’identification précoce d’indicateurs de conditions telles que la démence et le cancer. En intégrant les données protéomiques avec les ensembles de données génétiques et d’imagerie existants, les chercheurs visent à développer des outils pratiques pour prédire le risque de maladie et adapter les stratégies de prévention tant au niveau individuel qu’au niveau populationnel. La combinaison de l’analyse des protéines, des données génétiques et d’imagerie crée une opportunité unique pour étudier les interactions complexes entre ces variables. En identifiant des biomarqueurs protéiques, l’étude pourrait également conduire au développement de traitements ciblés pour les maladies liées à l’âge.

Avec plus de 19 000 chercheurs utilisant déjà les données du UK Biobank, l’ajout de la protéomique devrait indéniablement amplifier sa valeur en tant que ressource de recherche. Ce projet a le potentiel de relever certains des défis les plus pressants en matière de santé, permettant ainsi d’améliorer la santé et la longévité des générations futures. Source : https://longevity.technology/news/uk-biobank-announces-largest-ever-proteomics-study/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=uk-biobank-announces-largest-ever-proteomics-study

L’Immunosénescence : Comprendre le Vieillissement du Système Immunitaire et ses Implications pour la Santé

Le vieillissement du système immunitaire, connu sous le nom d’immunosénescence, joue un rôle crucial dans le vieillissement dégénératif global. Le système immunitaire dépasse le simple rôle de défense contre les agents pathogènes et les cellules dysfonctionnelles ; il est également essentiel pour le maintien des tissus, leurs fonctions et la régénération après une blessure. À mesure que l’âge avance, le système immunitaire devient plus inflammatoire et moins efficace, ce qui compromet ces fonctions vitales. Les données biologiques abondent concernant le fonctionnement du système immunitaire, permettant de développer des outils d’évaluation qui reflètent l’âge biologique et le fardeau de dommages pouvant mener à la mortalité. Pour cela, il est essentiel d’évaluer de manière précise l’âge immunitaire d’un individu, ce qui est fondamental pour élaborer des interventions ciblées sur le vieillissement. Bien que les méthodes traditionnelles d’évaluation de l’âge biologique, telles que les marqueurs de sénescence cellulaire et les indicateurs physiologiques, aient été largement utilisées, elles ne parviennent pas toujours à saisir la complexité du vieillissement biologique. C’est pourquoi nous proposons le concept d’une ‘horloge d’immunosénescence’, qui évalue les changements dans le système immunitaire en fonction de l’abondance des cellules immunitaires et des données omiques, y compris les données transcriptomiques et protéomiques. Cette approche ne vise pas à mesurer l’âge biologique de manière définitive, mais se divise en une horloge de prédiction de l’âge biologique, qui reflète l’état physiologique à travers les données transcriptomiques des cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC), et une horloge de prédiction de la mortalité, qui identifie les personnes à haut risque de mortalité et de maladies. Nous présentons ici presque toutes les horloges d’immunosénescence développées jusqu’à présent, ainsi que leurs différences fonctionnelles. Il est essentiel de noter qu’aucun test de diagnostic unique ne peut capturer de manière exhaustive les changements complexes associés au vieillissement biologique. De plus, les fonctions biologiques basées sur l’accélération ou le ralentissement de l’immunosénescence sont également résumées, ainsi que les facteurs qui accélèrent l’immunosénescence et les méthodes permettant de la retarder. Une compréhension approfondie des mécanismes régulateurs de l’immunosénescence peut aider à établir des modèles d’âge immunitaire plus précis, soutenant ainsi des interventions de longévité personnalisées et améliorant la qualité de vie des personnes âgées. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/reviewing-aging-clocks-focused-on-immunosenescence/