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Fauna Bio lance une plateforme d’IA pour la découverte de cibles thérapeutiques

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Fauna Bio, une entreprise de biotechnologie basée à Emeryville, en Californie, a récemment lancé une nouvelle plateforme d’intelligence artificielle nommée « Fauna Brain » pour améliorer la découverte de médicaments. Cette innovation s’appuie sur la biologie unique de mammifères remarquablement résilients afin d’identifier des cibles thérapeutiques basées sur des traits de résistance aux maladies. Fauna Bio utilise des techniques de génomique comparative pour mettre en évidence les mécanismes génétiques conservés chez des espèces ayant évolué pour développer des adaptations physiologiques extrêmes, comme la capacité à hiberner, à se régénérer et à résister au cancer, à la fibrose et à des troubles métaboliques. Avec plus de 46 milliards de lectures de séquences et des milliers de jeux de données omiques, la plateforme Fauna Brain vise à cartographier les traits protecteurs des animaux contre les voies de maladies humaines, révélant ainsi des cibles thérapeutiques prometteuses. Ce système, décrit comme un « système multi-agents », est capable de gérer de manière autonome des tâches complexes, telles que l’identification et la priorisation des cibles médicamenteuses, la synthèse des preuves et la génération de fiches conceptuelles détaillant les mécanismes thérapeutiques et les profils risque-bénéfice. Selon la PDG de Fauna, Ashley Zehnder, Fauna Brain marque une avancée significative dans la traduction de la résilience animale en thérapeutiques humaines. La plateforme peut évaluer des cibles médicamenteuses individuelles en environ 2,5 minutes pour un coût moyen d’un cent, ce qui permet une évaluation rapide et parallèle de nombreux candidats. Fauna Bio a déjà identifié deux cibles qui ont progressé vers des programmes de recherche collaboratifs avec un grand partenaire pharmaceutique. En plus de son approche innovante, Fauna Bio a récemment dévoilé son premier candidat en développement ciblant l’insuffisance cardiaque, et son pipeline interne inclut des programmes dans des domaines tels que les maladies cardiovasculaires, la neuroprotection, l’obésité et la dégénérescence rétinienne. Une collaboration avec Lilly, estimée à 494 millions de dollars, témoigne de l’intérêt des grandes entreprises pharmaceutiques pour l’approche unique de Fauna. Source : https://longevity.technology/news/fauna-bio-launches-ai-powered-target-discovery-platform/

Impact du microbiome intestinal sur le vieillissement et les maladies liées à l’âge

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Le microbiome intestinal est un ensemble complexe de milliers d’espèces microbiennes qui coexistent dans notre intestin, dont certaines sont bénéfiques tandis que d’autres peuvent être nuisibles. La capacité de mesurer avec précision la composition de ce microbiome, notamment grâce au séquençage du gène 16S rRNA, a permis de faire le lien entre les changements dans le microbiome intestinal et le vieillissement, la santé et les maladies. Bien que cette recherche soit encore à ses débuts, il est anticipé que l’intérêt pour le développement de moyens novateurs visant à modifier le microbiome intestinal pour des raisons thérapeutiques augmentera. La composition du microbiome intestinal est généralement résistante aux changements à court terme dus à l’alimentation, à l’utilisation de probiotiques et prébiotiques, ou à des antibiotiques légers. Cependant, sur plusieurs décennies, des changements significatifs dans l’équilibre des populations microbiennes se produisent, souvent défavorables. Les microbes inflammatoires peuvent croître aux dépens de ceux qui produisent des métabolites essentiels au bon fonctionnement des tissus. Ces changements peuvent être attribués à des modifications alimentaires sur le long terme, au déclin de la fonction immunitaire qui joue un rôle de régulateur du microbiome, ainsi qu’à d’autres facteurs. Bien qu’il existe des moyens de modifier de manière permanente le microbiome intestinal, tels que l’immunisation contre la flagéline qui cible les microbes problématiques, et la transplantation de microbiote fécal (TMF) d’un donneur jeune à un receveur âgé, des incertitudes demeurent quant à ce qui constitue un microbe bénéfique. Les chercheurs s’orientent probablement vers la culture de mélanges spécifiques de microbes pouvant être administrés de manière contrôlée. Le vieillissement est associé à des changements notables dans la composition et la fonction du microbiote intestinal, avec une diminution de la diversité microbienne et des changements dans l’abondance de certains groupes bactériens. Par exemple, une augmentation d’Escherichia coli et d’autres Proteobacteria est souvent observée, tandis que des bactéries bénéfiques telles que Bacteroides et Bifidobacterium diminuent, ce qui est essentiel pour la santé intestinale et le bien-être général. Les centenaires, un sous-groupe fascinant de personnes âgées, représentent un modèle intéressant pour étudier la longévité et les altérations du microbiote intestinal qui pourraient faciliter un vieillissement plus sain. Ces changements dans le microbiote sont influencés par divers facteurs, y compris les modifications alimentaires, une réduction de l’activité physique, une augmentation de l’utilisation de médicaments et des changements physiologiques dans le tractus gastro-intestinal. Le déclin des bactéries bénéfiques et la prolifération de microbes pathogènes contribuent à un environnement intestinal déséquilibré, souvent désigné sous le terme de dysbiose. La dysbiose chez les personnes âgées a été associée à diverses conditions liées à l’âge, telles que l’inflammaging, le déclin cognitif, la neurodégénérescence, la résistance à l’insuline, le diabète de type 2, les maladies cardiovasculaires et le cancer. En raison du rôle critique du microbiote intestinal dans le vieillissement et les maladies liées à l’âge, un intérêt croissant se manifeste pour les interventions ciblant le microbiote afin de promouvoir un vieillissement sain. En plus des modifications alimentaires, les probiotiques, les paraprobiotiques, les prébiotiques, les synbiotiques et les facteurs solubles microbiens (postbiotiques) suscitent une attention significative pour leur potentiel à moduler le microbiote intestinal et à améliorer la santé des personnes âgées. Bien qu’encore à l’étape expérimentale pour les conditions liées à l’âge, la transplantation de microbiote fécal a montré des promesses en restaurant un microbiote sain et en améliorant les fonctions métaboliques et immunitaires chez les adultes âgés, selon des études animales. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/06/reviewing-what-is-known-of-the-role-of-the-gut-microbiome-in-aging-2/

L’Horloge CheekAge : Une avancée dans l’épigénétique et la santé

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Une nouvelle étude publiée dans la revue GeroScience souligne les associations entre l’Horloge épigénétique de vieillissement de nouvelle génération, CheekAge, et une variété de maladies et de conditions. CheekAge est à la base du test TallyAge, un test non invasif à domicile utilisant un échantillon buccal proposé par la société de longévité Tally Health. En comparant CheekAge avec cinq autres horloges de vieillissement épigénétique, l’étude a analysé 25 ensembles de données de méthylation de l’ADN disponibles publiquement, révélant des corrélations significatives entre CheekAge et 33 variables de santé et de maladie. Parmi celles-ci, on trouve le trouble dépressif majeur, le traumatisme psychologique, la maladie du foie gras non alcoolique, la fibrose pulmonaire, le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et plusieurs types de cancers et de tumeurs. Le Dr Adiv Johnson, responsable des affaires scientifiques de Tally Health, a souligné que les résultats de cette recherche permettent d’identifier des signaux de santé nouvellement associés à des âges épigénétiques plus jeunes ou plus âgés à travers six horloges de vieillissement épigénétique différentes. Par exemple, l’étude a observé un vieillissement épigénétique accéléré chez les individus exposés au PBB-153, un produit chimique industriel persistant et perturbateur endocrinien, ajoutant ainsi à un corpus croissant de preuves que le vieillissement humain est influencé par des facteurs environnementaux. L’étude a également identifié des sites spécifiques de méthylation de l’ADN qui influencent la précision prédictive de CheekAge. Ces résultats fournissent des informations biologiques plus profondes sur la façon dont certains modèles méthylomiques contribuent à diverses maladies et conditions. En identifiant des processus biologiques pertinents et des cibles de facteurs de transcription, l’étude vise à mettre en lumière la connexion entre épigénétique, santé et vieillissement. Les recherches indiquent également des sites de méthylation de l’ADN uniques qui renforcent ou affaiblissent les associations avec CheekAge, offrant des perspectives biologiques nouvelles et une compréhension approfondie des relations entre certains modèles méthylomiques et diverses maladies. Tally Health, cofondée par le chercheur renommé en vieillissement Dr David Sinclair, adopte une approche combinant des tests répétés d’âge épigénétique avec des interventions personnalisées, dans le but de produire des améliorations mesurables de l’âge biologique. La société affirme que les clients ayant réalisé des tests pendant plus de six mois ont constaté une réduction moyenne de TallyAge de près de dix mois, tandis que ceux qui ont continué pendant plus d’un an ont réalisé une amélioration moyenne de plus de 1,5 an. Max Shokhirev, auteur principal de l’étude et responsable de la biologie computationnelle et des sciences des données chez Tally Health, a déclaré que CheekAge, le modèle computationnel qui a inspiré le test TallyAge, capture une large gamme de signaux biologiques associés à la maladie et à la santé. La méthode de collecte par écouvillon buccal employée par la société est jugée plus attrayante pour les consommateurs qu’un test sanguin, et elle permet de capter efficacement ce qui se passe dans le corps, ouvrant la voie à de futures horloges spécifiques à la santé comme une horloge de ménopause ou de fertilité, sans perturber l’expérience utilisateur. Source : https://longevity.technology/news/new-study-shows-cheekage-clock-is-significantly-associated-with-health-and-disease-variables/

Rôle des Astrocytes dans le Vieillissement Cérébral et l’Inflammation Chronique

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Les astrocytes sont des cellules gliales de soutien présentes dans le cerveau, jouant un rôle crucial dans le maintien du métabolisme et de la structure des tissus cérébraux. Une part importante du cerveau est constituée d’astrocytes. En réponse à des facteurs de stress, des infections ou des blessures, les astrocytes adoptent un état réactif. Bien que cette réaction soit bénéfique à court terme, elle peut contribuer à une inflammation chronique et à une perte de fonction cérébrale à long terme, ce qui est associé au vieillissement. Au fur et à mesure que les individus vieillissent, il y a une diminution de l’homéostasie dans les tissus, ce qui affecte la régulation des fonctions des organites et la réponse aux dommages. Dans le système nerveux central, de nombreuses fonctions régulatrices sont attribuées aux astrocytes dans des conditions homéostatiques, permettant un fonctionnement neuronal efficace. Les astrocytes jouent un rôle clé dans le métabolisme et la génération d’énergie et sont également impliqués dans la détection et la gestion des dommages. Ils sont nécessaires au maintien et à la régulation de la stabilité des synapses et de l’activité neuronale, qui peuvent être perturbées lors du vieillissement avancé. Les neurones délèguent également à ces cellules des espèces endommagées, comme des organites dysfonctionnels et des lipides affectés par des espèces réactives de l’oxygène, pour leur dégradation. Comprendre comment les astrocytes régulent ces processus en conditions homéostatiques et comment leurs fonctions normales déclinent avec l’âge est crucial pour analyser les phénotypes de vieillissement cérébral et la dégénérescence. Les astrocytes jouent un rôle essentiel en réponse à des agressions telles que les maladies, les infections/inflammations, les traumatismes neuronaux et les perturbations du métabolisme de l’organisme. En plus de leurs nombreuses fonctions en conditions normales, les astrocytes réagissent à des circonstances uniques en mettant en œuvre des réponses spécifiques en état de stress. Ces astrocytes réactifs peuvent perdre leurs capacités homéostatiques et/ou acquérir des fonctions supplémentaires, comme la prolifération, la formation de cicatrices, la neurotoxicité ou la régulation des cellules immunitaires. La nature contextuelle et multifacette de la réactivité des astrocytes suggère que les états de ces cellules au cours du vieillissement normal dépendent probablement de signaux extrinsèques qui s’accumulent au cours de la vie. Par exemple, le vieillissement est associé à une inflammation et à des infections accrues, ainsi qu’à la sénescence et aux maladies métaboliques. Comment les astrocytes synthétisent ces signaux pendant le vieillissement et modifient leurs états de base reste largement inconnu. Les changements spécifiques observés chez les astrocytes âgés, tant intrinsèques qu’en lien avec leurs interactions cellulaires à long terme, sont mal compris et ont été difficiles à explorer avec une grande fidélité. De nouveaux outils analytiques en développement, tels que le séquençage unicellulaire et les stratégies de caractérisation multi-omiques, ont commencé à décrire les astrocytes âgés, mais davantage de travaux sont nécessaires pour comprendre pleinement les conséquences fonctionnelles de ces altérations et comment elles se produisent dans différents contextes et conditions pathologiques. Une meilleure caractérisation fonctionnelle des astrocytes âgés fournira probablement des informations sur les mécanismes des maladies liées au vieillissement et proposera des voies pour aborder les phénotypes cérébraux liés à l’âge à l’avenir. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/03/the-contribution-of-aging-astrocytes-to-brain-inflammation-and-disease/

Analyse des Changements Transcriptomiques du Cerveau Liés au Vieillissement chez la Souris

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Le vieillissement biologique est un processus complexe caractérisé par une perte progressive de l’homéostasie à travers divers aspects de la fonction moléculaire et cellulaire. Cette étude se concentre sur l’analyse des changements transcriptomiques dans le cerveau de souris adultes jeunes et âgées, en utilisant des données de séquençage d’ARN à cellule unique. Les chercheurs ont réussi à établir un ensemble de données comprenant environ 1,2 million de transcriptomes de cellules cérébrales, révélant des signatures d’expression génique associées à l’âge. Grâce à un clustering de haute résolution, 847 clusters cellulaires ont été identifiés, dont au moins 14 clusters présentent un biais d’âge, principalement parmi les types de cellules gliales. Les résultats montrent une diminution de l’expression des gènes liés à la structure et à la fonction neuronale dans de nombreux types de neurones, accompagnée d’une augmentation des gènes associés à la fonction immunitaire, à la présentation des antigènes, à l’inflammation et à la motilité cellulaire. En particulier, certaines cellules du noyau hypothalamique, telles que les tanycytes et les cellules épendymaires, montrent une sensibilité accrue au vieillissement, suggérant que cette région pourrait jouer un rôle clé dans le vieillissement cérébral. Les découvertes de cette étude fournissent une base essentielle pour explorer les interactions entre le vieillissement normal et les maladies, ouvrant la voie à de futures recherches sur les mécanismes sous-jacents du vieillissement et leur impact sur la santé. En somme, cette recherche met en lumière un paysage dynamique de changements transcriptomiques spécifiques aux types cellulaires dans le cerveau en relation avec le vieillissement, contribuant ainsi à la compréhension des modifications fonctionnelles durant le vieillissement et leur interaction avec les maladies. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/a-transcriptomic-map-of-brain-aging-in-mice/