Étiquette : horloge transcriptomique

Les chercheurs ont développé une horloge basée sur la transcription pour estimer l’âge cérébral, utilisée pour identifier d’éventuelles interventions contre la neurodégénérescence liée à l’âge. Bien que le vieillissement cérébral et la neurodégénérescence soient étroitement liés, ils ne sont pas identiques. Des travaux antérieurs ont montré que des approches visant à traiter le vieillissement cérébral, comme l’utilisation de facteurs de Yamanaka pour faciliter le rajeunissement épigénétique, offrent de meilleurs résultats dans les modèles. Cependant, il est difficile de trouver des approches sûres et efficaces pour les humains. Les chercheurs ont noté des distinctions entre les approches transcriptomiques et protéomiques, qui mesurent l’expression de l’ARN et des protéines, et les approches épigénétiques qui mesurent la méthylation de l’ADN. Bien que les épigénétique soient plus stables et meilleures pour estimer l’âge, cette horloge transcriptomique se concentre sur l’identification des changements dans la fonction cellulaire, plus facilement interprétables. L’équipe avait précédemment créé une horloge similaire pour la peau, mais c’est leur première exploration pour le cerveau. Pour générer leur horloge, ils ont utilisé des données bulk provenant de plusieurs grandes bases de données, comprenant des données liées à la maladie d’Alzheimer, un projet d’expression tissulaire et une étude sur les lésions cérébrales traumatiques. Au total, 778 personnes uniques (toutes en bonne santé, avec un âge variant de 20 à 97 ans) ont été étudiées, résultant en 2 458 échantillons et 43 840 profils transcriptionnels. Leur horloge utilise les transcriptions de 365 gènes pour évaluer comment les interventions pourraient affecter le cerveau. Bien que ce ne soit pas une horloge épigénétique, elle s’est révélée très précise pour estimer l’âge chronologique. Les résultats ont montré une erreur moyenne de 2,55 ans pour l’ensemble de test, et une validation externe a trouvé une déviation d’environ 6 ans. De plus, parmi les 365 gènes, 91 étaient spécifiques aux processus cérébraux, avec une fonctionnalité synaptique fréquemment observée. Un lien significatif a été trouvé entre la neuropathologie et le vieillissement transcriptomique cérébral ; les personnes atteintes de troubles neurodégénératifs avaient des cerveaux plus âgés selon cette horloge. Les chercheurs ont ensuite utilisé des ensembles de données de perturbations chimiques et génétiques pour identifier leurs impacts sur le transcriptome, découvrant 4 047 perturbations affectant les neurones et 5 770 les progéniteurs neuraux. Bien qu’il soit plus facile d’accélérer le vieillissement que de rajeunir, 971 perturbations ont signalé un rajeunissement des progéniteurs neuraux et 68 pour les neurones. Parmi les rajeunisseurs les plus puissants pour les progéniteurs neuraux étaient BGT-226 et WYE-354, inhibiteurs de mTOR. D’autres rajeunisseurs identifiés incluent des médicaments approuvés pour la leucémie et des composés expérimentaux. Certaines perturbations bénéfiques étaient directement liées aux caractéristiques connues du vieillissement. Par exemple, des composés anti-inflammatoires ont été prédits pour réduire l’âge transcriptomique. Les chercheurs ont testé une combinaison de trois composés chez des souris de 18 mois, ce qui a semblé réduire leur anxiété et a entraîné des changements significatifs au niveau transcriptomique, suggérant un rajeunissement fonctionnel. Cependant, cette combinaison n’a pas été évaluée pour une utilisation humaine et des recherches plus approfondies sont nécessaires pour déterminer si cette approche mènera à la découverte ou au repositionnement de nouveaux médicaments pour ralentir ou inverser certains aspects du vieillissement cérébral. Source : https://www.lifespan.io/news/a-brain-clock-for-finding-rejuvenating-medications/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=a-brain-clock-for-finding-rejuvenating-medications