Étiquette : données biologiques

Biostate AI et Harvard : Une avancée révolutionnaire dans la recherche sur le vieillissement grâce à K-Dense Beta

La startup Biostate AI, spécialisée dans l’intelligence artificielle générative, a récemment lancé K-Dense Beta, un système multi-agents qui vise à réduire les délais de recherche biomédicale de plusieurs années à quelques jours. En collaboration avec le professeur David Sinclair de l’École de Médecine de Harvard, Biostate AI a démontré l’efficacité de cette technologie dans le domaine de la recherche sur le vieillissement et la longévité. Contrairement à d’autres systèmes qui se concentrent sur des aspects spécifiques de la recherche, K-Dense est conçu pour gérer des cycles de recherche entiers, utilisant une suite d’agents IA spécialisés capables de concevoir des expériences, d’interpréter des données biologiques, de passer en revue la littérature, d’effectuer des analyses, d’exécuter du code dans des environnements sécurisés et de produire des rapports prêts à être publiés. Dans le domaine de la science du vieillissement et de la longévité, où les chercheurs font face à des volumes de données massifs et à de longues échelles de temps biologiques, la capacité d’exécuter des études complètes et vérifiables dans des délais considérablement réduits pourrait aider à accélérer de nouvelles découvertes. Récemment, K-Dense a été mis à l’épreuve au laboratoire de Sinclair, où il a été chargé de développer une horloge de vieillissement transcriptomique. Le système a analysé un ensemble de données de plus de 600 000 profils d’expression d’ARN, réduisant ce nombre à 60 000 échantillons de haute qualité et identifiant 5 000 gènes clés parmi plus de 50 000 possibilités. Les résultats de cette étude, récemment publiés dans un document préimprimé, montrent que l’IA a analysé d’énormes ensembles de données, identifié des marqueurs génétiques clés du vieillissement et construit des modèles prédictifs qui estiment non seulement l’âge biologique, mais fournissent également des mesures d’incertitude pour chaque prédiction. Sinclair a déclaré que K-Dense leur a permis de réaliser une étude de recherche complète en seulement quelques semaines, un travail qui nécessiterait normalement des mois ou des années d’analyse experte. De plus, la fonction d’estimation de confiance est particulièrement intéressante, car elle pourrait permettre aux chercheurs et aux cliniciens de savoir quand et où les prédictions pourraient être moins fiables, par exemple lors de transitions biologiques ou dans des populations particulièrement hétérogènes. Selon Biostate, l’architecture de K-Dense Beta imite une équipe de scientifiques indépendants, où les agents vérifient mutuellement leur travail contre des bases de données externes et intègrent les résultats dans le processus pour assurer la traçabilité et minimiser les erreurs. En intégrant des pipelines bioinformatiques standards, des bases de données curées et des outils tels qu’AlphaFold, le système peut également se connecter de manière modulaire à des logiciels externes via le Model Context Protocol, élargissant ainsi son champ d’application dans le domaine biomédical. K-Dense fonctionne sur Gemini 2.5 Pro de Google Cloud et a surpassé des modèles largement utilisés tels que GPT-5, GPT-4o et Claude 3.5 Sonnet dans un test de bioinformatique. Biostate a récemment levé 12 millions de dollars lors d’une Série A et a élargi ses collaborations avec des hôpitaux, des centres académiques et des partenaires biopharmaceutiques aux États-Unis, en Chine et en Inde. Actuellement, K-Dense Beta est testé avec des partenaires sélectionnés, une disponibilité plus large étant prévue plus tard dans l’année. Gopinath, le CTO de Biostate, a exprimé que la crise actuelle dans le domaine scientifique réside dans le fait qu’il y a trop de données et pas assez de ressources pour les évaluer. Avec K-Dense, ils ont créé un scientifique IA capable de travailler 24 heures sur 24, 7 jours sur 7, accélérant ainsi considérablement la découverte tout en maintenant des normes scientifiques rigoureuses. Source : https://longevity.technology/news/new-ai-tool-demonstrates-potential-to-accelerate-longevity-research/

L’impact de l’âge biologique sur le déclin cognitif : Analyse des horloges de vieillissement

Au cours des dernières années, les chercheurs ont développé de nombreuses horloges de vieillissement utilisant des techniques d’apprentissage automatique appliquées à de grandes quantités de données biologiques. Ces horloges ont pour but de prédire l’âge chronologique, le risque de mortalité et d’autres mesures d’intérêt. Si une personne présente un âge prédit supérieur à son âge chronologique, on parle d’âge biologique accéléré. Un des principaux défis actuels est que la plupart de ces horloges sont difficiles à interpréter, car peu d’informations sont disponibles sur la façon dont les valeurs individuelles qui composent l’algorithme sont liées aux mécanismes sous-jacents du vieillissement ou aux résultats spécifiques des dysfonctionnements et maladies liés à l’âge. Pour améliorer cette situation, il est suggéré de multiplier les études sur ces horloges afin d’accumuler des données et d’observer les résultats. Une étude récente a examiné le déclin cognitif lié à l’âge, en utilisant des données collectées sept ans auparavant. Les résultats montrent que l’âge biologique accéléré est corrélé à une perte plus importante de fonction cognitive. Les tests neuropsychologiques, comme le test de dessin d’horloge, sont utilisés pour mesurer les fonctions cognitives, et la version numérique de ce test permet une évaluation plus robuste. Dans l’étude Framingham Heart Study, il a été observé que des métriques d’accélération de l’âge épigénétique plus élevées prédisaient des scores inférieurs au dCDT environ sept ans plus tard. Les associations étaient plus fortes chez les participants plus âgés, et les résultats mettent en lumière un lien potentiel entre les processus de vieillissement systémique et le déclin cognitif. En conclusion, les résultats indiquent que l’avancement du vieillissement biologique, notamment à travers les métriques de DunedinPACE et GrimAge, est significativement associé à une performance cognitive plus faible chez les adultes plus âgés. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/09/evidence-for-accelerated-epigenetic-aging-to-correlate-with-loss-of-cognitive-function/

Lancement du Prix Longitude : Utiliser l’IA pour lutter contre la SLA

Le Prix Longitude sur la SLA (sclérose latérale amyotrophique) a été lancé avec un objectif ambitieux : récompenser les équipes utilisant l’intelligence artificielle (IA) pour identifier des cibles thérapeutiques pour cette maladie neurodégénérative, qui est la plus commune des maladies des neurones moteurs. Avec un financement de 7,5 millions de livres sterling, ce prix vise à encourager des approches innovantes dans un domaine où les progrès thérapeutiques sont urgents, surtout compte tenu de la rapidité de la progression de la SLA et du manque de traitements efficaces.

La SLA représente un défi majeur en matière de recherche médicale, car elle affecte les cellules nerveuses responsables du mouvement musculaire, entraînant une perte progressive des capacités motrices. Les patients ont généralement une espérance de vie de deux à cinq ans après le diagnostic, et bien que certains traitements existent, aucun ne parvient à stopper ou inverser la maladie.

Le Prix Longitude sur la SLA, soutenu par la Motor Neurone Disease Association et Challenge Works, va attribuer vingt prix de découverte de 100 000 livres en 2026, suivis d’une récompense finale d’un million de livres en 2031. L’initiative cherche à catalyser des efforts multidisciplinaires en réunissant un vaste ensemble de données sur la SLA, provenant de divers projets de recherche, afin de favoriser une analyse par IA qui pourrait révéler de nouvelles cibles médicamenteuses.

Le modèle de ce prix ne se limite pas à un financement significatif ; il représente également un changement fondamental dans l’approche de la recherche sur les maladies qui ont longtemps résisté aux traitements. En intégrant la neuroscience, l’apprentissage machine et la validation en laboratoire, le Prix Longitude encourage les équipes à démontrer non seulement leur compétence en IA, mais aussi leur capacité à traduire les découvertes en applications biologiques concrètes.

Cette initiative s’inscrit dans une tendance plus large vers une innovation dérisquée et collaborative dans le secteur biopharmaceutique. Le soutien public est également notable, avec une majorité de personnes prêtes à partager leurs données biologiques pour aider à la recherche sur la SLA. Les organisateurs espèrent que cette dynamique mettra en lumière l’urgente nécessité de traiter cette maladie dans le contexte plus vaste des défis liés au vieillissement de la population.

Si le Prix Longitude sur la SLA réussit, il pourrait servir de modèle pour d’autres initiatives visant à aborder des maladies neurodégénératives similaires, où des données abondantes existent mais où des percées thérapeutiques restent à réaliser. Le succès de cette approche pourrait transformer la recherche sur de nombreuses conditions liées à l’âge, en utilisant l’IA non seulement pour accélérer la découverte mais aussi pour remodeler complètement la façon dont cette recherche est menée. Source : https://longevity.technology/news/prize-aims-to-drive-ai-into-the-heart-of-als-drug-discovery/