Étiquette : âge chronologique

Développement d’une horloge transcriptomique pour estimer l’âge cérébral et identifier des interventions contre la neurodégénérescence

Les chercheurs ont développé une horloge basée sur la transcription pour estimer l’âge cérébral, utilisée pour identifier d’éventuelles interventions contre la neurodégénérescence liée à l’âge. Bien que le vieillissement cérébral et la neurodégénérescence soient étroitement liés, ils ne sont pas identiques. Des travaux antérieurs ont montré que des approches visant à traiter le vieillissement cérébral, comme l’utilisation de facteurs de Yamanaka pour faciliter le rajeunissement épigénétique, offrent de meilleurs résultats dans les modèles. Cependant, il est difficile de trouver des approches sûres et efficaces pour les humains. Les chercheurs ont noté des distinctions entre les approches transcriptomiques et protéomiques, qui mesurent l’expression de l’ARN et des protéines, et les approches épigénétiques qui mesurent la méthylation de l’ADN. Bien que les épigénétique soient plus stables et meilleures pour estimer l’âge, cette horloge transcriptomique se concentre sur l’identification des changements dans la fonction cellulaire, plus facilement interprétables. L’équipe avait précédemment créé une horloge similaire pour la peau, mais c’est leur première exploration pour le cerveau. Pour générer leur horloge, ils ont utilisé des données bulk provenant de plusieurs grandes bases de données, comprenant des données liées à la maladie d’Alzheimer, un projet d’expression tissulaire et une étude sur les lésions cérébrales traumatiques. Au total, 778 personnes uniques (toutes en bonne santé, avec un âge variant de 20 à 97 ans) ont été étudiées, résultant en 2 458 échantillons et 43 840 profils transcriptionnels. Leur horloge utilise les transcriptions de 365 gènes pour évaluer comment les interventions pourraient affecter le cerveau. Bien que ce ne soit pas une horloge épigénétique, elle s’est révélée très précise pour estimer l’âge chronologique. Les résultats ont montré une erreur moyenne de 2,55 ans pour l’ensemble de test, et une validation externe a trouvé une déviation d’environ 6 ans. De plus, parmi les 365 gènes, 91 étaient spécifiques aux processus cérébraux, avec une fonctionnalité synaptique fréquemment observée. Un lien significatif a été trouvé entre la neuropathologie et le vieillissement transcriptomique cérébral ; les personnes atteintes de troubles neurodégénératifs avaient des cerveaux plus âgés selon cette horloge. Les chercheurs ont ensuite utilisé des ensembles de données de perturbations chimiques et génétiques pour identifier leurs impacts sur le transcriptome, découvrant 4 047 perturbations affectant les neurones et 5 770 les progéniteurs neuraux. Bien qu’il soit plus facile d’accélérer le vieillissement que de rajeunir, 971 perturbations ont signalé un rajeunissement des progéniteurs neuraux et 68 pour les neurones. Parmi les rajeunisseurs les plus puissants pour les progéniteurs neuraux étaient BGT-226 et WYE-354, inhibiteurs de mTOR. D’autres rajeunisseurs identifiés incluent des médicaments approuvés pour la leucémie et des composés expérimentaux. Certaines perturbations bénéfiques étaient directement liées aux caractéristiques connues du vieillissement. Par exemple, des composés anti-inflammatoires ont été prédits pour réduire l’âge transcriptomique. Les chercheurs ont testé une combinaison de trois composés chez des souris de 18 mois, ce qui a semblé réduire leur anxiété et a entraîné des changements significatifs au niveau transcriptomique, suggérant un rajeunissement fonctionnel. Cependant, cette combinaison n’a pas été évaluée pour une utilisation humaine et des recherches plus approfondies sont nécessaires pour déterminer si cette approche mènera à la découverte ou au repositionnement de nouveaux médicaments pour ralentir ou inverser certains aspects du vieillissement cérébral. Source : https://www.lifespan.io/news/a-brain-clock-for-finding-rejuvenating-medications/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=a-brain-clock-for-finding-rejuvenating-medications

Étude des horloges épigénétiques : Corrélations entre l’âge et la méthylation de l’ADN dans différents types de tissus

Les horloges épigénétiques sont des algorithmes qui prédisent l’âge et d’autres phénotypes liés au vieillissement en utilisant des données de méthylation de l’ADN (DNAm) provenant d’échantillons de sang et de tissus humains. La plupart des horloges épigénétiques sont développées en appliquant des techniques d’apprentissage automatique à des données de méthylation de l’ADN dérivées des cellules immunitaires dans des échantillons de sang de personnes de différents âges. Ces horloges sont basées sur la fraction des génomes dans l’échantillon qui sont méthylés à des sites CpG spécifiques. Il n’est pas surprenant que ces horloges donnent des résultats différents lorsqu’elles sont appliquées à des données épigénétiques provenant d’échantillons de tissus plutôt que de sang, car tous les types cellulaires ne réagissent pas de la même manière au vieillissement épigénétique. Des recherches sont en cours pour développer des horloges universelles capables d’appliquer ces modèles à plusieurs espèces et tissus, cherchant ainsi des points communs entre eux. Cependant, les horloges les plus connues ont une performance médiocre en dehors du contexte dans lequel elles ont été fabriquées, c’est-à-dire les échantillons de sang. Une étude a été réalisée pour évaluer la performance des horloges DNAm sur des types de tissus non sanguins en appliquant des algorithmes DNAm à des données de méthylation provenant de neuf types de tissus humains différents. Les résultats ont montré que l’estimation moyenne de l’âge selon l’horloge DNAm variait considérablement d’un type de tissu à un autre, et les valeurs moyennes des différentes horloges variaient également au sein des types de tissus. Pour la plupart des horloges, la corrélation avec l’âge chronologique variait selon les types de tissus, le sang montrant souvent la corrélation la plus forte. Chaque horloge a montré une forte corrélation entre les tissus, avec des preuves d’une corrélation résiduelle après ajustement pour l’âge chronologique. Ce travail démontre que les différences dans le vieillissement épigénétique parmi les types de tissus entraînent des différences claires dans les caractéristiques des horloges DNAm. Des horloges épigénétiques spécifiques aux tissus ou types cellulaires sont nécessaires pour optimiser la performance prédictive des horloges DNAm dans les tissus et types cellulaires non sanguins. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/epigenetic-clocks-produce-different-results-by-tissue-type/