Étiquette : expression génique

L’Impact Moléculaire du Tabagisme et son Lien avec le Vieillissement Accéléré

Des chercheurs ont analysé les motifs moléculaires provenant de différents tissus obtenus chez plus de 700 personnes et ont appris que le tabagisme agit comme un accélérateur de vieillissement et implique des changements moléculaires dans des tissus au-delà de ceux directement exposés à la fumée de cigarette. Malgré les campagnes visant à réduire le tabagisme, cette pratique demeure courante et est considérée comme la principale cause de mortalité évitable dans le monde, entraînant 8 millions de décès par an. La mortalité liée au tabagisme est accrue en raison d’un risque accru de maladies respiratoires, cardiovasculaires, métaboliques, auto-immunes, rénales, infectieuses et de cancers. Les études précédentes ont principalement abordé les effets du tabagisme en se concentrant sur les voies respiratoires et le sang entier. Cependant, cette étude a élargi l’investigation à l’impact des cigarettes sur plusieurs tissus humains, utilisant le projet Genotype Tissue Expression (GTEx) qui contient des données de 46 types de tissus humains de 717 individus. Les chercheurs ont comparé l’expression des gènes dans différents tissus entre fumeurs et non-fumeurs. Le nombre de gènes exprimés différemment entre fumeurs et non-fumeurs variait selon les tissus, les plus grandes différences se produisant dans les poumons, le pancréas, la thyroïde et les cellules tapissant l’œsophage. La plupart des changements étaient spécifiques au tissu, 86 % des gènes montrant des changements liés au tabagisme étant altérés dans un seul tissu. Seuls quelques gènes dont l’expression a été régulée à la hausse par le tabagisme étaient communs à neuf tissus différents. Un sous-ensemble de ces gènes avait déjà été signalé comme étant up-régulé par l’exposition directe aux hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP), des produits chimiques formés lors du tabagisme. Cette connexion suggère que des composés toxiques issus du tabagisme atteignent également des tissus non directement exposés à la fumée. Un autre sous-ensemble de gènes altérés par le tabagisme dans plusieurs tissus est lié aux fonctions du système immunitaire et à l’inflammation. En plus de l’épigénétique, l’expression génétique peut être affectée par des changements de splicing. Les chercheurs ont observé des événements de splicing alternatif dans 17 tissus de fumeurs, les poumons, la thyroïde et le cœur étant les plus affectés. Environ la moitié des splicing alternatifs ont conduit à l’inclusion ou à l’exclusion d’un exon, entraînant des changements dans la protéine. L’autre moitié des événements de splicing alternatif a entraîné la perte de protéines fonctionnelles correctement codées. Une analyse plus approfondie a été axée sur les quatre tissus montrant le plus de changements liés au tabagisme en expression génique : le poumon, la thyroïde, le pancréas et la muqueuse œsophagienne. Une analyse d’images de ces tissus a suggéré des changements structurels, y compris au niveau cellulaire. Par exemple, dans le tissu thyroïdien, les chercheurs ont observé de plus gros follicules contenant du colloïde, les unités de stockage des hormones thyroïdiennes inactives, ce qui est cohérent avec l’association précédemment rapportée entre le tabagisme et la croissance irrégulière de la glande thyroïde. Les chercheurs suggèrent que le thiocyanate présent dans la fumée de cigarette pourrait jouer un rôle ici, car il inhibe l’absorption d’iode par la glande thyroïdienne, entraînant des problèmes dans la production d’hormones thyroïdiennes. Des recherches antérieures ont observé des similitudes entre les changements d’expression génique liés au tabagisme et au vieillissement dans les voies respiratoires. Ces chercheurs ont élargi l’analyse à différents tissus. Huit tissus ont montré que le chevauchement entre les gènes différentiellement exprimés liés au vieillissement et au tabagisme est plus élevé que ce qui serait attendu par hasard. Les changements dans l’expression des gènes vont dans la même direction, de nombreux gènes étant associés au système immunitaire et à l’inflammation. Au-delà de ces changements dans l’expression des gènes, le tabagisme a également induit des changements dans les motifs de méthylation. En comparant les sites méthylés aux motifs d’expression génique, il a été révélé que, dans l’ensemble, le tabagisme impactait la méthylation de l’ADN et l’expression génique de manière indépendante. Cependant, il y avait également certains motifs partagés entre les gènes dont l’expression est associée au tabagisme et le motif d’hypométhylation lié au tabagisme. Dans les deux groupes, les chercheurs ont noté une enrichissement dans les changements de fonctionnement liés au système immunitaire, suggérant une activation du système immunitaire. La plupart des observations décrites jusqu’ici dans cette étude étaient des associations, et non des liens causaux. Pour établir la causalité, les chercheurs se sont appuyés sur les résultats d’une étude précédente qui a identifié des sites de méthylation spécifiques ayant un effet causal sur les phénotypes liés au vieillissement. Le chevauchement des motifs de méthylation liés au tabagisme avec des sites de méthylation ayant un effet causal sur les phénotypes liés au vieillissement a montré un chevauchement substantiel dans les tissus pulmonaires. Ces résultats suggèrent un effet causal entre le tabagisme et le vieillissement accéléré des tissus, agissant à travers la méthylation de l’ADN sur des sites ayant un impact causal sur le vieillissement. Une analyse plus approfondie de différents sites de méthylation par quelques horloges épigénétiques suggérait que l’accélération de l’âge dans les poumons résulte de perturbations à des sites de méthylation protecteurs, c’est-à-dire des sites qui contribuent à une longévité saine. Les fumeurs sont toujours conseillés d’arrêter de fumer pour améliorer leurs résultats de santé ; cependant, l’arrêt impacte-t-il les changements d’expression génique et les motifs de méthylation de l’ADN ? Les chercheurs ont utilisé des données de fumeurs et de non-fumeurs et les ont comparées à des personnes ayant arrêté de fumer. Cette analyse a suggéré une réversibilité partielle parmi la plupart des gènes, du splicing et des événements de méthylation. Cependant, les chercheurs ont observé des changements d’expression à des gènes plus réversibles que non réversibles, rendant les ex-fumeurs plus similaires aux personnes qui n’ont jamais fumé en termes d’expression génique. Dans la méthylation de l’ADN, il y avait moins de sites réversibles que non réversibles, rendant les ex-fumeurs plus similaires aux fumeurs. En analysant les effets sur l’expression génique et la méthylation de l’ADN partagés entre le tabagisme et le vieillissement, les chercheurs ont noté que chez les personnes ayant arrêté de fumer, les sites de méthylation non réversibles dans les poumons étaient enrichis en sites de méthylation associés à des signatures de vieillissement, mais ce n’était pas le cas pour les sites réversibles et partiellement réversibles, suggérant que les effets du tabagisme qui affectent la méthylation de l’ADN en commun avec le vieillissement sont plus persistants dans le temps. Ce n’était pas le cas pour les changements d’expression génique. Dans l’ensemble, les résultats de cette étude soutiennent l’hypothèse selon laquelle le tabagisme entraîne un vieillissement accéléré, avec une dysrégulation du système immunitaire et de l’inflammation ayant un fort impact sur les deux processus. Bien que l’arrêt puisse aider à renverser certains des changements liés au tabagisme, il existe des signatures moléculaires qui pourraient persister longtemps. Source : https://www.lifespan.io/news/molecular-similarities-between-cigarette-smoking-and-aging/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=molecular-similarities-between-cigarette-smoking-and-aging

Avancées dans la compréhension et le traitement de la démence vasculaire

Les chercheurs rapportent une avancée dans la compréhension de la biochimie des interactions pathologiques entre les types cellulaires dans le contexte de la démence vasculaire (VaD). En cartographiant les niveaux d’expression génique dans les tissus vasculaires sains et malades, ils ont identifié une base thérapeutique potentielle dans un ensemble spécifique de niveaux d’expression altérés observés dans les microglies et les oligodendrocytes. L’étude présente des preuves initiales de la restauration de l’expression de deux gènes pour réduire la dysfonction vasculaire et la pathologie. Cependant, cette approche est essentiellement compensatoire, cherchant à éliminer une réaction inadaptée sans aborder les causes sous-jacentes. Cela pourrait offrir des bénéfices limités comparé à une approche qui ciblerait directement les causes, car celles-ci continueraient à engendrer d’autres préjudices. Néanmoins, c’est la méthode généralement adoptée par la communauté de recherche. La démence vasculaire représente environ 25 % de tous les cas de démence. Actuellement, il n’existe pas de traitements directs pour la VaD, et les thérapies symptomatiques existantes, telles que les inhibiteurs de la cholinestérase et la mémantine, montrent une efficacité limitée et échouent à cibler la pathologie vasculaire sous-jacente. La VaD résulte d’un flux sanguin cérébral altéré à cause de pathologies cérébrovasculaires, y compris les AVC ischémiques, les microinfarctus ou la maladie des petits vaisseaux chronique. Un obstacle majeur à l’avancement de la recherche sur la VaD est la compréhension incomplète des réponses spécifiques aux types cellulaires au sein de l’unité neurovasculaire (NVU), qui est l’interaction dynamique entre plusieurs types cellulaires. Cette NVU maintient l’homéostasie cellulaire et orchestre les réponses aux blessures à travers des interactions complexes médiées par la signalisation ligand-récepteur. Dans la VaD, les lésions ischémiques proviennent des cellules endothéliales et se propagent à travers le microenvironnement neurovasculaire, perturbant la communication intercellulaire et entraînant des dommages tissulaires et un déclin cognitif. Les réseaux intercellulaires spécifiques à la VaD, ou interactome, restent largement inexplorés. Pour relever ces défis, les chercheurs ont réalisé un séquençage d’ARN spécifique aux types cellulaires pour profiler les changements transcriptionnels dans les cellules gliales et vasculaires. Les cellules gliales et vasculaires de la substance blanche présentent des profils transcriptionnels spécifiques par rapport aux ensembles de données corticales et cérébrales entières. Les lésions ischémiques perturbent également les gènes associés au vieillissement de la substance blanche. Ils ont construit un interactome complet de la VaD, identifiant des voies de signalisation conservées altérées chez l’humain et la souris, et priorisé deux systèmes de signalisation ligand-récepteur candidats pour une validation fonctionnelle. Ces systèmes sont : (1) le composant de la matrice extracellulaire Serpine2 et son récepteur Lrp1, qui régulent la différenciation des oligodendrocytes et la myélinisation, et (2) l’axe de signalisation CD39-A3AR, qui module l’activation des microglies et la réparation tissulaire. Une expression réduite de Serpine2 favorise la différenciation des cellules progénitrices oligodendrocytaires, favorisant ainsi la réparation, tandis qu’un agoniste spécifique à A3AR, actuellement en essais cliniques pour le psoriasis, restaure l’intégrité tissulaire et la fonction comportementale dans le modèle de VaD. Cette étude révèle des cibles de signalisation intercellulaire et fournit une base pour le développement de thérapies innovantes pour la VaD. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/07/intracellular-signaling-mechanisms-that-offer-a-path-to-treating-vascular-dementia/

L’Activation Silencieuse du Chromosome X et son Rôle dans le Vieillissement Féminin

La régulation de l’expression génétique est cruciale pour le contrôle de la structure de l’ADN nucléaire emballé, car elle détermine les régions accessibles aux protéines de transcription. Ce contrôle devient dysfonctionnel avec l’âge, et il existe des différences de sexe dans les résultats de cette dysfonction, car les hommes et les femmes possèdent des chromosomes différents. Il reste à déterminer quels types de différences sont significatifs en ce qui concerne l’espérance de vie et les résultats liés au vieillissement chez les hommes et les femmes. Les chercheurs examinent le phénomène de l’activation silencieuse du chromosome X chez les femmes âgées, en se demandant si cela pourrait avoir une contribution significative aux différences sexuelles dans le vieillissement. Contrairement aux hommes, qui portent un chromosome X et un chromosome Y, les femmes ont deux chromosomes X dans chaque cellule. Toutefois, un des deux chromosomes X est effectivement silencieux et se replie en une structure compacte appelée corps de Barr, ne pouvant plus être lu. Sans ce mécanisme, les gènes sur le chromosome X seraient activés deux fois plus souvent chez les femmes que chez les hommes. Des études ont montré que certains gènes peuvent échapper à l’inactivation dans le corps de Barr, entraînant une activité génique plus élevée chez les femmes, ce qui pourrait influencer certaines maladies. Les chercheurs ont examiné les principaux organes de souris à différents stades de la vie. Chez les animaux âgés, la proportion de gènes ayant échappé à l’inactivation était en moyenne deux fois plus élevée que chez les animaux adultes, atteignant six pour cent au lieu de trois pour cent des gènes sur le chromosome X. Dans certains organes, comme les reins, ce pourcentage était encore plus élevé, atteignant près de neuf pour cent. Avec le vieillissement, les processus épigénétiques desserrent progressivement la structure compacte du chromosome X inactif, permettant à certains gènes de redevenir actifs. De nombreux gènes réactivés avec l’âge sont associés à des maladies. Les effets de ces gènes réactivés sur le développement des maladies doivent être étudiés dans des recherches futures, car cette augmentation de l’activité génique pourrait avoir des effets positifs dans certains cas et négatifs dans d’autres. Par exemple, le gène ACE2, qui s’active dans les poumons avec l’âge, peut aider à limiter la fibrose pulmonaire, tandis qu’une activité accrue du gène TLR8 chez les personnes âgées pourrait jouer un rôle dans des maladies auto-immunes comme le lupus à début tardif. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/06/silent-x-chromosome-activation-as-a-contribution-to-sex-differences-in-aging/

Développement d’Horloges Biologiques à Partir de Microglies: Une Nouvelle Approche pour Comprendre le Vieillissement

Les horloges biologiques, qui capturent l’âge biologique d’un individu, sont généralement développées à partir d’analyses de cellules et de tissus en vrac. Cependant, des études récentes montrent l’importance d’obtenir des informations au niveau des cellules uniques pour mieux comprendre le processus de vieillissement. Les microglies, des cellules immunitaires clés du cerveau, montrent des changements fonctionnels adaptatifs pendant le vieillissement et la maladie. Des ensembles de données de séquençage d’ARN à cellule unique (scRNA-seq) ont été générés pour profiler transcriptionnellement les microglies durant le vieillissement et le développement. En utilisant ces ensembles de données chez l’homme et chez la souris, les chercheurs ont développé et comparé des approches computationnelles pour établir des horloges de vieillissement robustes et applicables. Les résultats révèlent que les approches de résumé non supervisées, basées sur la fréquence, qui encodent les distributions de cellules à travers des sous-types moléculaires, parviennent à équilibrer précision, interprétabilité et efficacité computationnelle. Les marqueurs dérivés des microglies ont montré une forte précision dans la prédiction de l’âge chronologique à partir de trois ensembles de données de cellules uniques divers, suggérant que les microglies subissent des changements caractéristiques dans l’expression génique au cours du vieillissement et du développement. Les chercheurs ont également démontré l’applicabilité des horloges basées sur les microglies à des données de séquençage d’ARN en vrac, en tenant compte d’entrées environnementales comme le stress précoce de la vie. Cela indique un potentiel d’utilité large de leurs modèles à travers différentes modalités génomiques et pour tester des hypothèses sur la façon dont les facteurs environnementaux influencent l’âge du cerveau. Ces marqueurs dérivés des cellules uniques peuvent fournir des éclairages sur les déterminants du vieillissement cérébral, favorisant ainsi des interventions qui modulent positivement les trajectoires de santé et de maladie. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/05/building-an-aging-clock-from-microglial-transcriptomics/

Activation des Gènes Sur le Chromosome X Silencieux et Différences Cognitives entre les Sexes durant le Vieillissement

Cette étude menée par des chercheurs de l’UCSF utilise un modèle animal pour explorer les différences cognitives entre les sexes liées à l’âge, en se concentrant sur l’activation des gènes sur le chromosome X silencieux. Les femmes, qui ont deux chromosomes X, montrent des différences notables par rapport aux hommes, qui en ont un, en matière de longévité et de vieillissement cognitif. Selon la chercheuse principale, Dena Dubal, les femmes présentent un cerveau qui semble plus jeune et moins affecté par les déficits cognitifs liés à l’âge. Les chercheurs établissent un lien entre les différences génétiques entre les sexes, en particulier les gènes présents sur le chromosome X, et ces différences dans le vieillissement cognitif. Dans les cellules femelles, un chromosome X est souvent inactif, mais certains gènes échappent à cette inactivation, ce qui pourrait influencer les différences cognitives. L’inactivation du chromosome X se produit de manière aléatoire dans le corps, rendant l’étude des gènes plus complexe. Les chercheurs ont croisé deux souches de souris, l’une ayant le chromosome X actif et l’autre inactif, pour mieux comprendre l’expression des gènes. Ils ont analysé les expressions géniques dans des échantillons de cellules de l’hippocampe, une région clé du cerveau pour l’apprentissage et la mémoire, et ont découvert que l’expression de plusieurs gènes était activée sur le chromosome X silencieux chez les souris âgées. Ces résultats indiquent que le chromosome X silencieux se réactive tard dans la vie, ce qui pourrait ralentir le déclin cognitif. Parmi les gènes activés, le gène Plp1, lié à la myéline, a montré une augmentation d’expression avec l’âge, particulièrement dans le cerveau des femelles. Les chercheurs ont également observé que l’augmentation de l’expression de Plp1 dans des cellules spécifiques améliorait les capacités d’apprentissage et de mémoire chez les souris âgées, sans affecter leur activité générale ou leur niveau d’anxiété. L’étude soulève des questions sur les mécanismes biologiques sous-jacents aux différences de vieillissement cognitif entre les sexes, suggérant que les modifications épigénétiques pourraient jouer un rôle clé dans l’activation des gènes du chromosome X silencieux. Les résultats de cette recherche offrent une compréhension plus approfondie des différences liées au sexe dans le vieillissement et pourraient guider le développement d’interventions visant à améliorer la santé cognitive des deux sexes. Source : https://www.lifespan.io/news/activation-of-silent-x-chromosome-might-improve-cognition/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=activation-of-silent-x-chromosome-might-improve-cognition

Elamipretide : Une avancée dans l’amélioration de la fonction musculaire chez les souris âgées

Elamipretide, anciennement connu sous le nom de SS-31, est une molécule antioxydante ciblant les mitochondries, qui améliore la fonction mitochondriale. Bien que son mécanisme d’action ne soit pas entièrement compris, des recherches ont montré qu’il améliore la fonction musculaire chez des souris âgées, un résultat attendu, mais ne modifie pas l’âge épigénétique, ce qui est surprenant. Les horloges épigénétiques, qui évaluent l’âge biologique en se basant sur des modifications épigénétiques de l’ADN, ont des limites, mais la fonction mitochondriale est cruciale dans le processus de vieillissement. La diminution de la fonction musculaire cardiaque et squelettique liée au vieillissement est fortement associée à diverses comorbidités. Elamipretide a démontré une efficacité thérapeutique dans l’amélioration des conditions associées à la dysfonction mitochondriale dans des modèles cliniques et précliniques. Dans une étude, l’impact d’un traitement de 8 semaines avec Elamipretide a été examiné sur la prévalence de la fragilité, ainsi que sur la fonction des muscles squelettiques et cardiaques chez les souris C57BL/6J. Les résultats ont montré que l’état de santé, mesuré par l’indice de fragilité, la fonction diastolique et la force musculaire squelettique, diminue avec l’âge, la force musculaire changeant de manière dépendante du sexe. Le traitement par Elamipretide a atténué l’accumulation de la fragilité et a partiellement inversé ces déclins, comme en témoigne l’augmentation du stress cardiaque et de la résistance à la fatigue musculaire. Cependant, aucune modification statistiquement significative de l’expression génique ou des profils de méthylation de l’ADN n’a été détectée, indiquant peu de réorganisation moléculaire ou de réduction de l’âge biologique dans la plupart des groupes traités. L’analyse des voies métaboliques a révélé que le traitement par Elamipretide favorisait des changements pro-longevité dans l’expression génique, incluant l’upregulation des gènes impliqués dans le métabolisme des acides gras, la traduction mitochondriale et la phosphorylation oxydative, ainsi que la downregulation de l’inflammation. En somme, ces résultats indiquent que le traitement par Elamipretide est efficace pour atténuer les signes de sarcopénie et de dysfonction cardiaque dans un modèle de souris vieillissant, mais que ces améliorations fonctionnelles se produisent indépendamment des changements détectables dans l’âge épigénétique et transcriptomique. Ainsi, certains changements liés à l’âge dans la fonction peuvent être découplés des modifications de l’âge biologique moléculaire. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/03/elamipretide-ss-31-improves-muscle-function-but-doesnt-affect-epigenetic-age/

Augmentation des erreurs de traduction liées à l’âge : Une étude sur un modèle de souris luminescent

Les chercheurs ont développé un modèle de souris qui intègre une séquence d’ADN produisant une protéine luminescente uniquement en cas d’erreur de lecture (readthrough), lorsque la machinerie de traduction ignore un codon d’arrêt dans la séquence d’ADN. Cette méthode permet d’évaluer dans quelle mesure les erreurs de lecture augmentent avec l’âge, entraînant la production de molécules d’ARN aberrantes et des dysfonctionnements associés. Des preuves suggèrent qu’il y a une augmentation liée à l’âge des erreurs de traduction lors de la production d’ARN à partir de l’ADN. Cependant, il est difficile de déterminer dans quelle mesure le vieillissement dégénératif résulte de ce type de dysfonctionnement dans l’expression génique. La question de la précision de la synthèse des protéines et de son lien avec le vieillissement est un sujet d’intérêt de longue date. Pour étudier si des changements spontanés dans le taux d’erreurs ribosomiques se produisent en fonction de l’âge, les chercheurs ont d’abord établi que le readthrough des codons d’arrêt est un indicateur plus sensible de la mistraduction due à un appariement incorrect des codons et anticodons que l’incorporation d’acides aminés par erreur. Par la suite, ils ont développé des souris knock-in pour la détection in-vivo du readthrough des codons d’arrêt, utilisant un rapporteur de type Kat2-TGA-Fluc qui combine des techniques d’imagerie fluorescente et bioluminescente sensibles. Les chercheurs ont suivi l’expression des protéines rapporteurs in-vivo au fil du temps, et ont évalué l’expression de Kat2 et Fluc dans des extraits de tissus ainsi que par imagerie ex-vivo de tout organe. Les résultats montrent une augmentation organo-dépendante et liée à l’âge des erreurs de traduction : le readthrough des codons d’arrêt augmente avec l’âge dans les muscles (+75%) et le cerveau (+50%), mais pas dans le foie. En parallèle, des données récentes indiquent un vieillissement prématuré chez des souris présentant une mutation de ram sujette aux erreurs, soulignant que le déclin de la fidélité de traduction lié à l’âge pourrait contribuer au vieillissement. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/03/translational-errors-increase-with-age-in-some-organs-in-mice/

Reprogrammation Cellulaire : Vers une Réversion du Cancer Colorectal

Les cellules fonctionnent comme des machines d’état, leur comportement étant fortement influencé par le modèle d’expression génique qu’elles adoptent. Avec le temps, d’autres facteurs, tels que la présence de déchets moléculaires comme le lipofuscine, et des changements dans l’environnement extérieur, affectent les réactions cellulaires. Cela inclut le croisement de la matrice extracellulaire et des signaux inflammatoires. La maîtrise de l’expression génique pourrait permettre de réinitialiser le comportement des cellules et d’améliorer leur fonction, ce qui pourrait aussi entraîner un meilleur contrôle des maladies et du vieillissement. La recherche sur le reprogrammation cellulaire se concentre principalement sur le traitement du vieillissement en inversant certains changements d’expression génique. Les facteurs de Yamanaka, qui transforment les cellules germinales adultes en cellules souches embryonnaires, sont souvent au centre de ces travaux. Cependant, d’autres formes de reprogrammation sont possibles, comme la reprogrammation des cellules cancéreuses pour qu’elles ne soient plus cancéreuses. Cette recherche se concentre sur le cancer colorectal, avec une nouvelle technologie développée par la société Biorevert pour inverser les changements cancéreux. Une équipe de recherche a réussi à capturer le phénomène de transition critique où les cellules normales deviennent cancéreuses et a découvert un commutateur moléculaire capable de ramener les cellules cancéreuses à leur état normal. Ils ont identifié un état de transition critique instable où coexistent cellules normales et cancéreuses, et ont utilisé une méthode de biologie des systèmes pour développer une technologie d’identification des commutateurs moléculaires. En appliquant cette technologie aux cellules cancéreuses du côlon, ils ont pu prouver que ces cellules pouvaient retrouver les caractéristiques des cellules normales. Cette approche repose sur l’inférence automatique d’un modèle informatique du réseau génétique contrôlant la transition critique du développement cancéreux à partir de données de séquençage d’ARN à cellule unique. Les chercheurs ont identifié des commutateurs moléculaires qui suppressent la prolifération des cellules cancéreuses tout en restaurant les caractéristiques des cellules normales du côlon. Lorsqu’ils ont administré des inhibiteurs de ces commutateurs aux organoïdes dérivés de patients atteints de cancer colorectal, ils ont observé une inhibition de la prolifération des cellules cancéreuses et une activation des gènes liés à l’épithélium colique normal. Enfin, une approche systémique nommée REVERT a été présentée, permettant de reconstruire le modèle de réseau régulateur moléculaire et d’identifier un commutateur de réversion basé sur des données de transcriptome à cellule unique, illustrant son utilité dans l’étude des transitions de destinée cellulaire. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/02/more-on-reprogramming-of-colon-cancer-cells-into-normal-colon-cells/

Impact de l’âge et de la restriction calorique sur la sarcopénie : une analyse transcriptomique

L’impact du vieillissement sur les changements transcriptionnels dans les cellules est un domaine de recherche important. En examinant le transcriptome des cellules musculaires des rats âgés par rapport à ceux des jeunes et en tenant compte des interventions comme la restriction calorique, les chercheurs ont pu mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à la sarcopénie, qui est la perte de masse et de force musculaire liée à l’âge. Cette condition est une cause majeure de handicap chez les personnes âgées et nécessite une étude approfondie. En utilisant le séquençage d’ARN à haut débit, les chercheurs ont isolé l’ARN total des tissus musculaires de rats nourris ad libitum et de ceux soumis à une restriction calorique. Les analyses ont révélé des changements significatifs dans l’expression génique, avec 442 gènes codant pour des protéines étant régulés à la hausse et 377 à la baisse dans les muscles âgés par rapport aux jeunes. Les gènes régulés à la hausse étaient souvent liés à la réponse immunitaire et au repliement des protéines, tandis que ceux régulés à la baisse étaient plus associés à la biologie du développement. La restriction calorique a permis de supprimer 69,7 % des gènes régulés à la hausse et de sauver 57,8 % des gènes régulés à la baisse dans le muscle âgé, tout en identifiant des gènes uniques qui n’étaient pas affectés par le vieillissement. Ces données fournissent des indices importants pour de futures interventions thérapeutiques visant à lutter contre la sarcopénie. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/an-epigenetic-view-of-the-benefits-of-calorie-restriction-in-aged-rats/

Les Mécanismes de l’ARN dans les Maladies Neurodégénératives : De la Biologie à la Thérapie

L’assemblage, le traitement et les activités des molécules d’ARN dans la cellule constituent un sujet vastement complexe, particulièrement dans le contexte des maladies neurodégénératives. Cet article présente un aperçu des domaines d’intérêt pour les chercheurs travaillant sur ces conditions. La transcription des gènes en ARN est la première étape de l’expression génique, et des changements importants dans cette expression surviennent avec l’âge. Un état cellulaire est largement déterminé par les ARN et les protéines produites, influençant ainsi la fonction des tissus. Les maladies neurodégénératives, qui touchent environ 6,9 millions d’Américains en 2024, incluent la maladie d’Alzheimer, la maladie de Parkinson, ainsi que des maladies moins courantes comme la maladie de Huntington et la sclérose latérale amyotrophique. Bien que les symptômes cliniques varient, ces maladies partagent des mécanismes pathologiques sous-jacents, notamment la présence d’inclusions pathologiques et de mutations des protéines liant l’ARN. Des expansions de répétition dans plusieurs maladies, comme la SLA et la DFT, entraînent la production d’ARN contenant des répétitions, qui peuvent induire une neurotoxicité par différents mécanismes. Dans l’ère post-génomique, diverses voies de traitement de l’ARN et de nouveaux types d’ARN, codants et non codants, ont été identifiés dans le contexte des maladies, suggérant une contribution potentielle à la neurodégénérescence. Des stratégies thérapeutiques ciblant l’ARN pour moduler les gènes associés aux maladies ont montré un succès notable. Cet article se concentre sur les mécanismes pathogéniques liés à l’ARN dans les maladies neurodégénératives et sur les approches thérapeutiques ciblant l’ARN qui montrent un grand potentiel. Nous examinons d’abord les différentes voies de traitement de l’ARN et comment ces voies sont dysrégulées dans les maladies neurodégénératives. Ensuite, nous discutons des mécanismes de dysfonctionnement des protéines liant l’ARN, entraînant une régulation incorrecte du traitement de l’ARN. Enfin, nous passons en revue les progrès actuels dans les thérapies ciblant l’ARN. Les différentes voies de traitement de l’ARN sont souvent interconnectées, et la plupart des protéines liant l’ARN jouent des rôles multifonctionnels à travers plusieurs étapes, créant une interaction significative entre elles. Source : https://www.fightaging.org/archives/2025/01/rna-dysregulation-in-neurodegenerative-conditions/